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KAO-201实验案例
来源: | 作者:toroivd | 发布时间: 2022-05-06 | 277 次浏览 | 分享到:

 

 1.  高速 PCR

  使用 KAO-201 和进口 A 品牌按照各自说明书推荐的体系和程序对人基因组 DNA 进行扩增。KAO-201扩增时,1 kb 的目的片段延伸时间设定为 1 sec,1-10 kb 的目的片段延伸时间按 5 sec/ kb 设定。PCR产物的琼脂糖凝胶电泳结果如下图所示:


图1 高速PCR

Fig.1 Rapid PCR   

  结果:从琼脂糖凝胶电泳图中可以看到在扩增 4 kb 及 4 kb 以上的片段时,KAO-201 仍然可以得到清晰的单一扩增条带,而进口 A 品牌出现了模糊多带的情况。

  结论:KAO-201 能够对长片段模板进行高速高保真的 PCR 扩增。


 2.  粗样品PCR

  使用 KAO-201 和进口 A 品牌按照各自说明书推荐的体系和程序分别从血液和鼠尾裂解液中 PCR 扩增人的 β-globin 基因和小鼠的 Thy-1 基因。为避免误差,从低到高设置模板加样量为 1 µL、2 µL、3 µL、4 µL,PCR 产物的琼脂糖凝胶电泳结果如图 2-a 和 2-b 所示:


图2 粗样品 PCR

Fig.2 PCR of  raw sample

  结果:从血液直扩和鼠尾裂解直扩的琼脂糖凝胶电泳图中可以看到,使用 KAO-201 对两个粗样品扩增均可以得到清晰的电泳条带,而进口 A 品牌没有扩增条带。

  结论:KAO-201 高保真酶具有高抗抑制性,能够用于粗样品的 PCR 扩增。


 3.  高保真度

  选用多种 DNA 聚合酶并以人基因组 DNA 为模板扩增 β-globin 基因,对各PCR 产物进行 TA 克隆。随后从各克隆中抽提质粒,进行 Sanger 测序并确认序列,最后统计100,000碱基中的错配数用于保真度对比,碱基错配数如下图所示:


 

图3 高保真度

Fig.3 High fidelity

  结果:普通 Taq DNA 聚合酶在100,000 碱基中的错配数最高,Flash KOD(KAO-201)在100,000 碱基中的错配数最低,保真性大约是普通 Taq DNA 聚合酶的 80 倍。

  结论:KAO-201 具有高保真度,保真性大约是普通 Taq DNA 聚合酶的 80 倍,能有效避免 PCR 扩增中的碱基错配。  


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